تحقیق در مورد مطالعه شناسایی Pseudomonas syringae در خاک و گیاه

لینک پرداخت و دانلود *پایین مطلب*

فرمت فایل:Word (قابل ویرایش و آماده پرینت)

تعداد صفحه:13

 فهرست مطالب

مطالعه شناسایی  Pseudomonas syringae  در خاک و گیاه با استفاده از روش  تشخیص مستقیم توسط PCR

تنوع باکتری های دارای هسته یخ در برخی از محصولات زراعی وباغی استان خراسان

ایجاد موتان های فاقد هسته یخ (ice-) دراسترین های اپیفیت Pseudomonas syringae  و
 Pseudomonas fluorescens

تمایز جدایه های جدیدی از  Xanthomonas بر اساس پلی مرفیسم آرایش فضائی تک زنجیره و قطعات حاصل از برش ناحیه بین ژنی اسید نوکلئیک ریبوزومی

ردیابی و طبقه بندی فیلوژنتیکی فیتوپلاسماهای همراه با برخی گیاهان زراعی در استان کرمان

گونه های Sphingomonas به عنوان باکتری های اپی فیت درختان هلو و بوته های براکلی در گلستان و مازندران

لکه برگی باکتریائی مریم گلی ناشی از گونه ای زانتوموناس

توصیف مولکولی و جایگاه فیلوژنتیکی فیتوپلاسماهای همراه با زنجرک Orosius albicinctus در استان کرمان

ردیابی و شناسایی فیتوپلاسماهای همراه با برخی از علف های هرز با استفاده ازروش  PCR-RFLP در استان کرمان

در این تحقیق شناسایی   Pseudomonas syringae بوسیله روش مستقیم PCR   روی بافتهای زنده گیاهی، بقایای خشک گیاهی و خاک انجام گرفت. بدین منظور از گیاهان آلوده  خاک و بقایای گیاهی آلوده  به باکتری که یکسال از جدا کردن گیاهان آلوده به P. syringae    می گذشت نمونه برداری  انجام شد. نمونه ها در پلاستیک استوماشر  محتوی 2 میلی لیتر بافر  PBS قرار داده شدند. از نمونه ها عصاره گیری به عمل آمده و سپس  DNA سلولهای باکتری خالص سازی شدند. پنج میکرولیتر از DNA خالص شده و 5  میکرولیتر ماده Gen    Releser به لوله های اپندورف منتقل شده و عمل PCR  به تعداد یک سیکل انجام گردید. بلافاصله   DNA باکتری توسط آغازگرهای اختصاصی  HrpL1  و  HrpL2 مجددا عمل  PCR به تعداد  37  سیکل تحت برنامه مخصوص انجام گرفت. DNA  سلولهای باکتریهای تکثیر شده روی ژل الکتروفورز منتقل شدند. تمامی نمونه ها تشکیل یک باند  DNA با اندازه 600  جفت باز نشان دادند که با شاهد مثبت کاملا مطابقت داشت. جهت تائید نتایج،  DNA  تکثیر شده با آنزیم برش  Bsh 12361 هضم گردیدند و مجددا روی ژل الکتروفورز منتقل شدند. باندهای ایجاد شده روی ژل با باندهای شاهد مثبت کاملا مطابقت داشت. نتایج این تحقیق بوضوح مشخص نمود که سلولهای   P.syringae قادرند بیش از یکسال در خاک و بقایای گیاهی دوام داشته و از سالی به سال دیگر منتقل شوند.

Identification of Pseudomonas syringae in soil and plant materials by direct PCR

  M. Niknejad Kazempour Department of Plant Pathology Faculty of Agricultural Sciences, Guilan University

In this research, identification of Pseudomonas syringae on plant tissue, debris and soil by direct PCR method was examined. Soil and plant material contaminated by P.syringae for one year was collected. The samples were placed in stomacher plastics containing 2 ml PBS buffer. Extracts were prepared and the DNA was isolated. 5 μl of purified DNA was added to 5 μl of Gen Relesor in eppendorf tubes and a single cycle was carried. This was followed immediately by a 37 cyle PCR using the HrpL1 and HrpL2 primers. The DNA from PCR was electrophoresed and showed 600 pb fragment identical to the positive control. To verify this results, the amplified DNA was digested by restriction enzyme of Bsh 12361. The banding pattern attained correlated with those obtained for the positive control. The results obtained clearly demonstrate that  P.syringae is capable sustaining itself for at least one year in soil and plant material and can be transmitted from one year to the next.